来源：生信媛公众号。
我们第一周目标有三个:
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熟悉Linux环境
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登录服务器
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Linux基本命令
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PATH的意义
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学习conda管理环境
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如何在conda中添加channel
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如何用conda安装和卸载软件
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如何创建新的环境和切换环境
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数据准备
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参考序列
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注释信息
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测序数据
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首先，你需要有一个Linux环境，Windows10用户可以安装WSL，MacOS请在应用程序中搜索终端
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Windows10配置WSL: https://linux.cn/article-9545-1.html
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MacOS的环境配置: https://blog.csdn.net/orangleliu/article/details/47357339
然后，你需要学一些基础的Linux的命令操作，如下是鸟哥的Linux私房菜的对应链接
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目录管理:http://linux.vbird.org/linux_basic/0210filepermission.php
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vim使用说明: http://linux.vbird.org/linux_basic/0310vi.php
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shell基础: http://linux.vbird.org/linux_basic/0320bash.php 中的10.1，10.2，10.3和10.4
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再接着你需要用conda安装如下软件
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sra-tools: 数据下载
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fastqc: 查看数据质量
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cutadapt, trimmomatic: 数据质控
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star, hisat2: 数据比对
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samtools: SAM/BAM文件处理
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subread, htseq: 基因计数
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conda的教程推荐看https://www.jianshu.com/p/edaa744ea47d
接着你得下载如下数据：
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参考基因组序列: 在 http://www.ensembl.org/ 上下载 GRCh38的参考基因组序列
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注释文件：在 http://www.ensembl.org/ 上下载 GRCh38 对应的注释GFF文件
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SRR数据：编号为 SRR4820707,SRR4820708, SRR4820709,SRR4820710, SRR4820727, SRR4820728, SRR4820729, SRR4820730
第一周的视频如下：https://space.bilibili.com/249108235
