CRISPR-Cas是细菌用来抵抗外来生物抵御系统。经过广谱检测,人们发现了三种主要的CRISPR系统,它们由CRISPR-associated (Cas)基因、非编码rna和一组独特的重复元素(直接重复)组成,而这些重复序列则由来自外源性DNA靶点(即原间隔体)的短可变序列直接间隔开来;重复序列+间隔序列=CRISPR RNA (crRNA) array。在有DNA靶点的情况下,每一个间隔序列都有一个前间区序列邻近基序(PAM)。
II型CRISPR系统是最具特征的系统之一,它由核酸酶Cas9、编码引导rna的crRNA阵列和有助于将crRNA阵列加工成离散单元的所需辅助反式激活crRNA (tracrRNA)组成。
一、常见缩写及专业词汇
- clustered regularly interspaced short palindromic repeats (CRISPR) :就是一个剪短的成簇的短回文结构。
- DNA double-stranded breaks (DSBs) :双链断裂
- nonhomologous end joining (NHEJ):无模板修复,引入indel,适合敲除
- homology-directed repair (HDR):有模板修复,精准编辑。
- zinc-finger nucleases (ZFNs):锌指核酸酶
- transcription activator-like effector nucleases (TALENs):转录激活因子样效应物核酸酶
- single-stranded DNA oligonucleotides (ssODNs):单链DNA寡核苷酸
- CRISPR RNA (crRNA) array
- Streptococcus pyogenes:化脓性链球菌
- single-guide RNA (sgRNA)
- guide RNA (gRNA)