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keep hungry keep foolish
2024

2024-11-30-丁立的十一月科研随手记

包罗万象,从科研idea到心理建设,啥都有


2024-11-30-丁立的十一月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2024-10-31-丁立的十月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2024-09-30-丁立的九月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2024-08-31-丁立的八月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2024-08-01-生物信息学实用网站整理

持续更新


2024-07-31-丁立的七月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2024-06-30-丁立的六月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2024-05-31-丁立的五月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2024-04-30-丁立的四月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2024-03-31-丁立的三月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2024-02-29-丁立的二月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2024-01-31-丁立的一月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2023

2023-12-31-丁立的十二月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2023-11-30-丁立的十一月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2023-11-28-给朱云的R语言入门

持续更新


2023-10-31-丁立的十月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2023-09-30-丁立的九月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2023-08-31-丁立的八月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2023-07-31-丁立的七月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2023-06-30-丁立的六月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


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与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


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2023-03-31-丁立的三月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2023-02-28-丁立的二月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2023-01-31-丁立的一月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2022

2022-12-31-丁立的十二月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2022-11-30-丁立的十一月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2022-10-31-丁立的十月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2022-09-30-丁立的九月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2022-08-31-丁立的八月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2022-07-31-丁立的七月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2022-06-30-丁立的六月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2022-05-31-丁立的五月读书笔记

与人类伟大的灵魂对话,超越日常的忧虑和有限


2022-04-30-丁立的四月读书笔记

在阅读中探寻世界的欢沁与自己的迷途


2022-04-01-疼痛遗传学100篇paper

第一部分——第1到第10篇paper


2022-03-31-丁立的三月读书笔记

在阅读中探寻世界的欢沁与自己的迷途


2022-02-28-丁立的二月读书笔记

在阅读中探寻世界的欢沁与自己的迷途


2022-02-14-英文教科书Textbook of Pain读书笔记

Chapter 1——Peripheral Mechanisms of Cutaneous Nociception


2022-01-31-丁立的一月读书笔记

在阅读中探寻世界的欢沁与自己的迷途


2022-01-07-疼痛遗传学100篇paper

第二部分——第11到第20篇paper


2022-01-06-全基因组关联分析流程

GWAS工具汇总


2022-01-06-疼痛遗传学100篇paper

第一部分——第1到第10篇paper


2022-01-02-疼痛遗传学100个关键词

第二部分——第21到第40个关键词


2022-01-01-疼痛遗传学100个关键词

第一部分——第1到第20个关键词


2021

2021-12-31-丁立的十二月读书笔记

在阅读中探寻世界的欢沁与自己的迷途


2021-11-30-丁立的十一月读书笔记

在阅读中探寻世界的欢沁与自己的迷途


2021-10-31-丁立的十月读书笔记

在阅读中探寻世界的欢沁与自己的迷途


2021-09-30-丁立的九月读书笔记

在阅读中探寻世界的欢沁与自己的迷途


2021-08-31-丁立的八月读书笔记

在阅读中探寻世界的欢沁与自己的迷途


2021-07-31-丁立的七月读书笔记

在阅读中探寻自己的迷执与迷途


2021-06-30-丁立的六月读书笔记

在阅读中探寻自己的迷执与迷途


2021-06-30-专业英语的Abstract


2021-05-31-丁立的五月读书笔记

在阅读中探寻自己的迷执与迷途


2021-05-21-单细胞数据分析流程整理(详细代码及主要结果)

The description of scRNA-seq analysis


2021-04-30-丁立的四月读书笔记

在阅读中探寻自己的迷执与迷途


2021-04-04-全基因组关联分析100个关键词

第四部分——第61到第80个关键词


2021-04-03-全基因组关联分析100个关键词

第三部分——第41到第60个关键词


2021-04-02-全基因组关联分析100个关键词

第二部分——第21到第40个关键词


2021-04-01-全基因组关联分析100个关键词

第一部分——第1到第20个关键词(偏向群体遗传学基础知识)


2021-03-31-丁立的三月读书笔记

在阅读中探寻自己的迷执与迷途


2021-03-31-三月份的文献精读


2021-03-20-GWAS学习笔记系列(一)

01-分析路线图和02-表型数据清洗


2021-03-19-GWAS操作笔记系列(三)

关联分析3-5:GLM模型进行GWAS分析+数值+因子+PCA协变量


2021-03-18-GWAS操作笔记系列(三)

关联分析3-4:GLM模型进行GWAS分析+数值+因子协变量


2021-03-17-GWAS操作笔记系列(三)

关联分析3-3:GLM模型进行GWAS分析+因子协变量


2021-03-16-GWAS操作笔记系列(三)

关联分析3-2:GLM模型进行GWAS分析+数值协变量


2021-03-15-GWAS操作笔记系列(三)

关联分析3-1:GLM模型进行GWAS分析


2021-03-14-GWAS操作笔记系列(二)

质控2-6:去掉亲缘关系近的个体


2021-03-13-GWAS操作笔记系列(二)

质控2-5:杂合率检验


2021-03-12-GWAS操作笔记系列(二)

质控2-4:哈温平衡检验


2021-03-11-GWAS操作笔记系列(二)

质控2-3:MAF过滤


2021-03-10-GWAS操作笔记系列(二)

质控2-2:性别质控


2021-03-09-GWAS操作笔记系列(二)

质控2-1:缺失质控


2021-03-08-GWAS操作笔记系列(一)

1-下载数据


2021-02-28-丁立的二月读书笔记

在阅读中探寻自己的迷执与迷途


2021-02-11-单细胞转录组100个关键词

第三部分——第41到第60个关键词


2021-02-10-单细胞转录组100个关键词

第二部分——第21到第40个关键词


2021-02-09-单细胞转录组100个关键词

第一部分——第1到第20个关键词


2021-02-07-二月第一周的protocol精读

人类疼痛敏感性的遗传组成:健康志愿者实验性疼痛的GWAS protocol


2021-01-31-丁立的一月读书笔记

在阅读中探寻自己的迷执与迷途


2021-01-30-单细胞文献阅读系列一

单细胞RNA-seq数据分析最佳实践


2021-01-20-单细胞转录组分析实战

Seurat学习笔记


2021-01-18-一月第四周的文献精读

人类皮肤衰老的单细胞转录组图谱


2021-01-11-一月第三周的文献精读

拉美人群混合


2020

2020-12-31-丁立的十二月读书笔记

在阅读中探寻自己的迷执与迷途


2020-12-17-单细胞转录组初探系列二

单细胞优秀示例之Scater包


2020-12-16-单细胞转录组初探系列一

单细胞优秀示例之scRNA-seq包


2020-12-04-文献精读6

《Dev Cell》:A Single-Cell Transcriptomic Atlas of Human Skin Aging


2020-11-30-丁立的十一月读书笔记

在阅读中探寻自己的迷执与迷途


2020-11-13-Integration and Label Transfer

Seurat_3.0包学习笔记(二)


2020-11-10-Guided Clustering Tutorial

Seurat_3.0包学习笔记(一)


2020-11-02-GWAS系列文章三

Chip Data QC Pipeline


2020-10-31-丁立的十月读书笔记

在阅读中探寻自己的迷执与迷途


2020-10-28-Skin_traits_preanalysis

R代码整理


2020-10-09-RNA-seq转录组数据分析入门

入门知识及实战pipline


2020-09-30-丁立的九月读书笔记

在阅读中探寻自己的迷执与迷途


2020-08-31-丁立的八月读书笔记

在阅读中探寻自己的迷执与迷途


2020-08-25-JoVE Core 生物学系列课程分享1

第一部分-基本原理(第1、第2和第3章)


2020-08-25-早教军备竞赛的科学结论

全文转载


2020-08-21-全基因组重测序基础及高级分析知识汇总

生信类最新分享


2020-08-09-为什么新一代女生容易抑郁

全文转载


2020-07-31-丁立的七月读书笔记

在阅读中探寻自己的迷执与迷途


2020-07-20-GWAS系列文章二

GWAS的分析基本流程及分析思路


2020-07-13-基于Salmon+DESeq2的转录组分析流程

实践生物信息学系列文章一


2020-07-07-R Graphics Cookbook读书笔记2

第三章-条形图


2020-07-02-R Graphics Cookbook读书笔记1

第一章-R语言基础和第二章-快速浏览数据


2020-06-23-GWAS系列文章一

GWAS入门前的Q&A


2020-06-18-单细胞测序系列文章八

单细胞转录组数据处理之细胞亚群比例比较


2020-06-16-单细胞测序系列文章七

单细胞转录组数据处理之细胞亚群继续分群


2020-06-14-单细胞测序系列文章六

单细胞转录组数据处理之细胞亚群注释


2020-06-12-单细胞测序系列文章五

单细胞转录组数据处理之降维聚类分群


2020-06-10-单细胞测序系列文章四

单细胞转录组数据处理之数据质控


2020-06-08-单细胞测序系列文章三

单细胞转录组数据处理之上游分析流程


2020-06-06-单细胞测序系列文章二

单细胞测序基础知识


2020-06-05-单细胞测序系列文章一

Illumina提供的单细胞测序工作流程


2020年2月-生物学研究热点

生物类(侧重植物领域)最新科研成果分享


2020年1月-生物学研究热点

生物类(侧重植物领域)最新科研成果分享


2019

2019年12月-生信领域热点

生信类最新干货分享


2019年12月-生物学研究热点

生物类(侧重植物领域)最新科研成果分享


2019-12-15-《进化生物学》学习笔记

第一篇 生物信息学概述


2019年11月-生信领域最前沿

生信类最新分享


2019年11月-生物学研究热点

生物类(侧重植物领域)最新科研成果分享


2019-11-20-CRISPR/Cas9系列文章五

第五篇 CRISPR-Cas9实验流程


2019-11-19-CRISPR/Cas9系列文章四

第四篇 CRISPR-Cas9实验流程


2019-11-18-CRISPR/Cas9系列文章三

第三篇 CRISPR-Cas9基因敲除原理及其应用


2019-11-15-CRISPR/Cas9系列文章二

第二篇 张峰protocol介绍


2019-11-14-CRISPR/Cas9系列文章一

第一篇 CRISPR-Cas9系统简介


2019年10月-生信领域最前沿

生信类最新分享


2019年10月-生物学研究热点

生物类(侧重植物领域)最新科研成果分享


2019年9月-生信领域最前沿

生信类最新分享


2019年9月-生物学研究热点

生物类(侧重植物领域)最新科研成果分享


2019-09-15-水稻只做转录组能不能发篇3分的SCI?

公众号文章分享


2019-09-02-RNA-seq上下游分析流程整理

上游分析部分代码


2019-08-31-丁立的八月读书笔记

在阅读中探寻自己的迷执与迷途


2019年8月-生信领域最前沿

生信类最新分享


2019年8月-生物学研究热点

生物类(侧重植物领域)最新科研成果分享


2019-08-28-一个月能通过转录组入门生信吗?

学转录组入门生信系列文章


2019-08-28-第一周 从环境配置开始

学转录组入门生信系列文章二


2019-08-28-第二周 来获取表达量矩阵

学转录组入门生信系列文章三


2019-08-28-第三周 R语言和学习DESeq2

学转录组入门生信系列文章四


2019-08-28-第四周 根据差异基因进行富集分析及解读

学转录组入门生信系列文章五


2019-06-31-丁立的六月读书笔记

读书笔记


2019-06-30-生物信息学实用工具整理

生物信息干货


2019-06-02-文献精读4

Antisense transcription regulates the expression of sense gene via alternative polyadenylation


2019-05-03-文献精读3

Position-specific intron retention is mediated by the histone methyltransferase SDG725senescence


2019-04-30-生物信息学100个基础问题

第十一到第二十题


2019-04-15-生物信息学100个基础问题

第一到第十题


2019-04-12-文献精读2

3′ UTR lengthening as a novel mechanism in regulating cellular senescence


2019-03-26-文献精读1

Alternative polyadenylation dependent function of splicing factor SRSF3 contributes to cellular senescence


2019-01-30-《Bioinformatics and Functional Genomics》读书笔记

第二章 序列数据检索


2019-01-19-《Bioinformatics and Functional Genomics》读书笔记

第一章 生物信息学概述


2019-01-16-日本晴水稻相关的实用tips

基因格式转换及下游分析


2019-01-13-什么是转座子

转座子的分类及在植物中的分布


2019-01-10-DNA甲基化测序数据处理系列3

第三部分--实战篇之差异分析


2019-01-08-DNA甲基化测序数据处理系列2

第二部分--实战篇之数据比对


2019-01-06-DNA甲基化测序数据处理系列1

第一部分--DNA甲基化及测序方法介绍


2019-01-02-Linux去可视化命令

精简实用的Linux命令


2019-01-01-Bioconductor中的Gene Expression Workflow

(原创翻译1)-gene-level exploratory analysis and differential expression


2018

2018-12-30-RNA-seq分析流程整理

水稻GSE81436的RNA-seq分析流程(Cr-DJ_osddm1a1b)


2018-12-13-Linux十大常用命令

罗静初老师版本


2018-12-10-科研思路2

植物抗性基因家族分析所用到的数据库和软件


2018-12-09-基因家族科研思路1

植物抗性基因家族思路解析


2018-12-05-《Mechanisms of Gene Regulation》读书笔记

第四篇 非编码RNA篇(第13章)


2018-12-04-《Mechanisms of Gene Regulation》读书笔记

第三篇 染色质篇(第10、11、12章)


2018-12-03-《Mechanisms of Gene Regulation》读书笔记

第三篇 染色质篇(第8、9章)


2018-12-02-《Mechanisms of Gene Regulation》读书笔记

第二篇 转录因子篇(第5、6、7章)


2018-12-01-《Mechanisms of Gene Regulation》读书笔记

第二篇 转录因子篇(第3、4章)


2018-11-30-《Mechanisms of Gene Regulation》读书笔记

第一篇 概述(第1、2章)


2018-11-21-编程实战题

生信技能树20个题目


2018-11-20-生物信息学数据库资源

常用生信数据库的介绍


2018-11-19-生物信息学入门最佳实践

生物信息学习流程


2018-11-18-NGS数据存放类型

高通量数据文件格式


2018-11-16-Linux文本操作

Linux基础知识入门


2018-11-15-Python入门

Python基础知识介绍


2018-11-14-Perl入门5

正则表达式


2018-11-13-Perl入门4

Perl文件操作及特殊变量


2018-11-12-Perl入门3

Perl条件语句及循环


2018-11-11-Perl入门2

Perl数据类型


2018-11-10-Perl入门1

Perl基础知识介绍


2018-11-09-Linux基础知识

Linux入门


2018-11-08-学会使用R语言进行数据分析

R语言入门


2018-11-07-一种搜索水稻中NBS-LRR序列的方法

以HMM模型为基础


2018-11-06-植物免疫反应及其机制

植物先天免疫


2018-10-31-Linux软件安装

用conda安装RNA-seq所需要的工具


2018-10-31-Gaining comprehensive biological insight into the transcriptome by performing a broad-spectrum RNA-seq analysis

转录组分析工具大比拼(完整翻译版)


2018-10-29-使用R语言分析Microarray芯片数据

Bioiconductor包分析芯片数据入门


2018-10-28-隐马尔科夫模型相关

HMM模型及HMMER软件的介绍


2018-10-20-生信分析中的常见文件格式

常见文件的格式以及查看方式


2018-10-15-NGS常见概念

高通量测序领域常用名词解释


2017

2017-12-31-基因表达分析之富集分析

基于R包


2017-10-07-《Epgenetics》(美)Allis,C.D,等著

读书笔记————第5到第11章


2017-10-03-《Epgenetics》(美)Allis,C.D,等著

读书笔记————第1到4章