LiDing Blog

Thinking will not overcome fear but action will.

2020-11-02-GWAS系列文章三

Chip Data QC Pipeline

零、背景介绍 0.1 bed/bim/fam格式 0.1.1 bed文件 bed:Primary representation of genotype calls at biallelic variants. （真实的bed文件是二进制的，比较难读） Must be accompanied by .bim and .fam files. Loaded with –bfil...

Posted by DL on November 2, 2020

2020-10-31-丁立的十月读书笔记

在阅读中探寻自己的迷执与迷途

2020.10.01 周四：   “第二座山”是布鲁克斯发明的概念。他说人生要爬两座山，第一座山是关于“自我（ego）”的，你希望自己越来越成功、越来越厉害，要实现自我，获得幸福。第二座山，却是关于别人的，是关于“失去自我”的：你为了别人，或者为了某个使命，而宁可失去自我。专注于第一座山的人未必能想明白为啥要爬第二座山，但是你终将明白。   第一座山有两种爬法。   一种是像王枫这样，...

Posted by DL on October 31, 2020

2020-10-28-Skin_traits_preanalysis

R代码整理

1.Venn图 Draw Venn Diagram 2.Summary_description skin_data <- read.table(file="your file",sep="\t",header=T,row.names=1) summary_result <- summary(skin_data) write.csv(summary_result,file="...

Posted by DL on October 28, 2020

2020-10-09-RNA-seq转录组数据分析入门

入门知识及实战pipline

一、RNA-seq分析的介绍 1. Recent Developments 1.1 Advances in RNA-seq technologies 1.2 Different Pipelines 1.3 General Workflow 2. Prerequisite knowledge 2.1 Data Format (1) FASTA ...

Posted by DL on October 9, 2020

2020-09-30-丁立的九月读书笔记

在阅读中探寻自己的迷执与迷途

2020.09.01 周二：   有十万亿个左右的细胞拥挤在你的衣服下面，其中九成都不是人类的细胞！没错，数千种共生访客在数量上超过了宿主细胞，也就是来自你父母结合后形成的受精卵的细胞。这些共生访客中不仅有细菌，还有真核生物，包括单细胞微生物以及多细胞生物：真菌、睫毛上或身体其他什么地方的螨虫、只有用显微镜才能观察到的蠕虫或更大个儿的蠕虫，没准儿还有其他什么东西。你是一个行走的生态系统，有...

Posted by DL on September 30, 2020

2020-08-31-丁立的八月读书笔记

在阅读中探寻自己的迷执与迷途

2020.08.04 周二：   卡尔维诺：时间流逝的目的只有一个，就是让感觉和思想稳定下来，成熟起来，摆脱一切急躁或者须臾的偶然变化。   弗里德里希·尼采：强者是能够在任何情况下行动和再行动的人；虚弱的人则是只能怨而恨之。 2020.08.05 周三：   “你千万别这样想，”克里博士提高声音说，“你不是愚人金，只在特定的光线下才发光。无论你成为谁，无论你把自己变成了什么，那...

Posted by DL on August 31, 2020

2020-08-25-早教军备竞赛的科学结论

全文转载

本文来源：《精英日课第三季》，万维钢 著，得到精品课。   现在中国学龄前儿童的家长们正在面临一场军备竞赛。我们这一讲要说的是这是一场愚蠢的比赛，聪明理性的人不应该参加。周围大多数人都在做的事情，不一定就是对的事情。   当前中国国情，学习的竞争早就发生在小学入学之前，而学习班的市场已经覆盖到了零至三岁。四岁开始学英语，五岁会算数学题似乎是新标准。据说有的小学已经不好好教汉语拼音...

Posted by DL on August 25, 2020

2020-08-25-JoVE Core 生物学系列课程分享1

第一部分-基本原理（第1、第2和第3章）

来源：JoVE Core 第1章 科学探究 1.1 什么是生物学？ 生物学是一门自然科学，专注于生命和生物的研究，包括它们的结构，功能，发展，相互作用，进化，分布和分类。 该领域的范围很广泛，分为几个专业学科，如解剖学，生理学，行为学，遗传学等等。 所有生物都有一些共同的关键特征：细胞组织、可遗传的遗传物质和适应/进化的能力、调节能量需求的新陈代谢、与环境互动的能力、维持体内...

Posted by DL on August 25, 2020

2020-08-21-全基因组重测序基础及高级分析知识汇总

生信类最新分享

来源：微笑如酒的360doc文档 1.背景   借着2月8号，刚刚在Nature上发表柑橘的遗传进化的文章，小编来讲述一下全基因组重测序基础知识，以及常见的分析思路及软件，帮助大家迅速入门。   全基因组重测序是通过对已有参考序列（Reference Sequence）的物种的不同个体进行基因组测序，并以此为基础进行个体或群体水平的遗传差异性分析。通过全基因组重测序，研...

Posted by DL on August 21, 2020

2020-08-09-为什么新一代女生容易抑郁

全文转载

本文来源：《精英日课第三季》，万维钢 著，得到精品课。   一代人有一代人的新问题。我在大学毕业之前好像就没听说过“抑郁症”这个词。抑郁症变成流行词汇之后，有的人还以为这是一种时髦的矫情，是为了吸引注意力而故作姿态。我曾经一度认为抑郁症是现代医学过度诊断的结果。三十年以前那些为生活奔忙的人，那些天天念叨工作和房子的人，那些从事集体劳动的工人和农民，那些连温饱都没解决的人，他们没得什...

Posted by DL on August 9, 2020

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