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2019-11-20-CRISPR/Cas9系列文章五

第五篇 CRISPR-Cas9实验流程

参考资料：水稻多基因敲除系统–中国水稻研究所 王克剑实验室 1. 原理   利用Cas9 蛋白在多个gRNA 引导下对基因组多个特异区段产生双链断裂的特性，创制水稻基因组定点突变体（见图1）。 2. 系统特点 快捷：编辑4个以内位点，可以进行载体的快速构建。 高效：一次转化，高频率创制多突变体。 无限：理论上可以同时...

Posted by DL on November 20, 2019

2019-11-19-CRISPR/Cas9系列文章四

第四篇 CRISPR-Cas9实验流程

参考资料：CRISPR实验流程 一、利用Cas9质粒建立knock-out 细胞系实验的详细过程 1.1 确定待敲除基因的靶位点 1.2 设计识别靶位点的识别的一对DNAOligo（引物） 1.3 构建表达sgRNA的质粒 1.4 sgRN活性检测 1.5 利用Cas9质粒建立knock-out细胞系 1.1 确定待敲除基因的靶位点   根据提供的物种...

Posted by DL on November 19, 2019

2019-11-18-CRISPR/Cas9系列文章三

第三篇 CRISPR-Cas9基因敲除原理及其应用

参考资料：Genloci Classic CRISPR-Cas9内部操作流程 1. 知识回顾   CRISPR（clustered，regularly interspaced，short palindromic repeats）是一种来自细菌降解入侵的病毒DNA或其他外源DNA的免疫机制。在细菌及古细菌中，CRISPR系统共分成3类，其中I类和Ⅲ类需要多种CRISPR相关蛋白（C...

Posted by DL on November 18, 2019

2019-11-15-CRISPR/Cas9系列文章二

第二篇 张峰protocol介绍

参考资料：protocol-使用CRISPR-Cas9系统进行基因编辑   CRISPR-Cas是细菌用来抵抗外来生物抵御系统。经过广谱检测，人们发现了三种主要的CRISPR系统，它们由CRISPR-associated (Cas)基因、非编码rna和一组独特的重复元素(直接重复)组成，而这些重复序列则由来自外源性DNA靶点(即原间隔体)的短可变序列直接间隔开来；重复序列+间隔...

Posted by DL on November 15, 2019

2019-11-14-CRISPR/Cas9系列文章一

第一篇 CRISPR-Cas9系统简介

参考资料：CRISPR-Cas9系统简介 一、背景 1.1 目前已有的基因编辑技术 （1）锌指核酸内切酶(zinc finger endonuclease，ZFN)：是第一代人工核酸内切酶。锌指是一类能够结合DNA的蛋白质，人类细胞的转录因子中大约有一半含有锌指结构，ZFN 是将锌指蛋白与核酸内切酶 Fok I融合形成的核酸内切酶，利用它可以在各种复杂基因组的特...

Posted by DL on November 14, 2019

2019年10月-生物学研究热点

生物类（侧重植物领域）最新科研成果分享

2019年10月第1周 2019.10.03 — Nature | RNA剪接和表观调控的协同变化驱动白血病的发生 来源： 章台柳 BioArt https://mp.weixin.qq.com/s/lBo-wDnMDGkPxLVn3Tflzw   该研究在一种白血病亚型中鉴定出表观遗传的改变和RNA剪接间的病理性协同作用，提供了剪接因子突变能够驱动髓系恶性肿瘤...

Posted by DL on October 31, 2019

2019年10月-生信领域最前沿

生信类最新分享

2019年10月第1周 2019.10.02 — 生信分析人员如何系统入门python（2019更新版） 来源： zoe 生信技能树 https://mp.weixin.qq.com/s/o6sCuGtaLAwjTQwBS7GjHw 2019年10月第2周 2019.10.06 — 当我们谈论生信的时候我们在谈什么 来源： 生信宝典 http...

Posted by DL on October 31, 2019

2019年9月-生物学研究热点

生物类（侧重植物领域）最新科研成果分享

2019年9月第1周 2019.09.02 — PNAS | 拟南芥DNA去甲基化调控机制 来源： BioArt植物 https://mp.weixin.qq.com/s/CNO0ftYAB5b8xrBNhvxdSg 2019.09.04 — Genome Biology | 曹晓风/钱文峰揭示拟南芥poly(A)尾介导的全新转录后调控机制 来源： B...

Posted by DL on October 1, 2019

2019年9月-生信领域最前沿

生信类最新分享

2019年9月第1周 2019.09.04 — 万能转换：R图和统计表转成发表级的Word、PPT、Excel、HTML、Latex、矢量图等 来源： 生信宝典 https://mp.weixin.qq.com/s/OtOpfob4fnqWJ3Ah-y36mA  &emspR包export可以轻松的将R绘制的图和统计表输出到 Microsoft Office ...

Posted by DL on October 1, 2019

2019-09-15-水稻只做转录组能不能发篇3分的SCI？

公众号文章分享

参考资料：生信媛公众号 https://mp.weixin.qq.com/s/5eoigYx_ZdKxDa-rcH_OhQ 答案是不能，你还得补充一些定量PCR对找到差异基因做验证。 1. 文章简介 文章标题: Genes, pathways and transcription factors involved in seedling stage chilling...

Posted by DL on September 15, 2019

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