LiDing Blog

Thinking will not overcome fear but action will.

2019-11-15-CRISPR/Cas9系列文章二

第二篇 张峰protocol介绍

参考资料：protocol-使用CRISPR-Cas9系统进行基因编辑   CRISPR-Cas是细菌用来抵抗外来生物抵御系统。经过广谱检测，人们发现了三种主要的CRISPR系统，它们由CRISPR-associated (Cas)基因、非编码rna和一组独特的重复元素(直接重复)组成，而这些重复序列则由来自外源性DNA靶点(即原间隔体)的短可变序列直接间隔开来；重复序列+间隔...

Posted by DL on November 15, 2019

2019-11-14-CRISPR/Cas9系列文章一

第一篇 CRISPR-Cas9系统简介

参考资料：CRISPR-Cas9系统简介 一、背景 1.1 目前已有的基因编辑技术 （1）锌指核酸内切酶(zinc finger endonuclease，ZFN)：是第一代人工核酸内切酶。锌指是一类能够结合DNA的蛋白质，人类细胞的转录因子中大约有一半含有锌指结构，ZFN 是将锌指蛋白与核酸内切酶 Fok I融合形成的核酸内切酶，利用它可以在各种复杂基因组的特...

Posted by DL on November 14, 2019

2019年10月-生物学研究热点

生物类（侧重植物领域）最新科研成果分享

2019年10月第1周 2019.10.03 — Nature | RNA剪接和表观调控的协同变化驱动白血病的发生 来源： 章台柳 BioArt https://mp.weixin.qq.com/s/lBo-wDnMDGkPxLVn3Tflzw   该研究在一种白血病亚型中鉴定出表观遗传的改变和RNA剪接间的病理性协同作用，提供了剪接因子突变能够驱动髓系恶性肿瘤...

Posted by DL on October 31, 2019

2019年10月-生信领域最前沿

生信类最新分享

2019年10月第1周 2019.10.02 — 生信分析人员如何系统入门python（2019更新版） 来源： zoe 生信技能树 https://mp.weixin.qq.com/s/o6sCuGtaLAwjTQwBS7GjHw 2019年10月第2周 2019.10.06 — 当我们谈论生信的时候我们在谈什么 来源： 生信宝典 http...

Posted by DL on October 31, 2019

2019年9月-生物学研究热点

生物类（侧重植物领域）最新科研成果分享

2019年9月第1周 2019.09.02 — PNAS | 拟南芥DNA去甲基化调控机制 来源： BioArt植物 https://mp.weixin.qq.com/s/CNO0ftYAB5b8xrBNhvxdSg 2019.09.04 — Genome Biology | 曹晓风/钱文峰揭示拟南芥poly(A)尾介导的全新转录后调控机制 来源： B...

Posted by DL on October 1, 2019

2019年9月-生信领域最前沿

生信类最新分享

2019年9月第1周 2019.09.04 — 万能转换：R图和统计表转成发表级的Word、PPT、Excel、HTML、Latex、矢量图等 来源： 生信宝典 https://mp.weixin.qq.com/s/OtOpfob4fnqWJ3Ah-y36mA  &emspR包export可以轻松的将R绘制的图和统计表输出到 Microsoft Office ...

Posted by DL on October 1, 2019

2019-09-15-水稻只做转录组能不能发篇3分的SCI？

公众号文章分享

参考资料：生信媛公众号 https://mp.weixin.qq.com/s/5eoigYx_ZdKxDa-rcH_OhQ 答案是不能，你还得补充一些定量PCR对找到差异基因做验证。 1. 文章简介 文章标题: Genes, pathways and transcription factors involved in seedling stage chilling...

Posted by DL on September 15, 2019

2019-09-02-RNA-seq上下游分析流程整理

上游分析部分代码

来源：根据徐洲更B站视频整理。 1.分析准备：软件的安装 1.1安装miniconda3 wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-4.7.10-Linux-x86_64.sh 1.2安装miniconda3 sh Miniconda3-4.6.14-Linux-×86_6...

Posted by DL on September 2, 2019

2019年8月-生物学研究热点

生物类（侧重植物领域）最新科研成果分享

2019年8月第3周 2019.08.14—转录调控研究简史 来源：郑渊铭、方熠 BioArt https://mp.weixin.qq.com/s/Uz1TCj2SCErdzaobeolhMg 2019年8月第4周 2019.08.19—【Nature综述】延缓衰老从理论到实践 来源：淼淼 BioArt https://mp.weixin...

Posted by DL on August 31, 2019

2019年8月-生信领域最前沿

生信类最新分享

2019年8月第1周 2019.08.01—《手把手带你学 Python3 | 字典与FASTA文件序列抽提》 来源：大土豆力 生信菜鸟团 https://mp.weixin.qq.com/s/vYT2s16IfP1StvxFilWLZQ 安装入门环境首选 pycharm。 f = open('test.fa','rt') f = f.readlines() s...

Posted by DL on August 31, 2019

FEATURED TAGS
学习笔记 R语言与Bioconductor 生物信息学基础 生信方法 Linux 文献精读 生物学基础 Perl Python 生物信息学题目 科研思路 RNA-seq BS-seq 读书笔记 领域最前沿 CRISPR-Cas9 scRNA-seq GWAS R 群体遗传学 Pain 科研随手记
ABOUT ME

Goals determine what you going to be!

✉️ 20110700034@fudan.edu.cn